北京市在生物多样性保护方面取得了显著成效。近年来，本市通过划定生态保护红线和建设各类自然保护区，为生物多样性提供了有力的空间保障。同时，通过建立生态示范区、生态保育小区等多种形式的生态空间，有效拓展了动植物的栖息地。
在保护措施方面，北京市建立了定期评估机制，对重要生态区域进行系统性监测和质量评价，确保生态系统的健康与稳定。通过科学评估和动态清零策略，本市成功改善了多个生态区域的质量，如潮白河流域湿地面积的显著增加和水系连通性的提升。
物种保护方面，北京市构建了以国家植物园、动物园及动物救助中心为核心的迁地保护体系。目前，国家植物园已收集保存超过1.8万种植物，并建立了多种国家重点保护野生植物的保护技术体系。北京南海子麋鹿苑则专注于麋鹿的保护与繁育工作，不断壮大种群规模，并在全国范围内推广。
此外，北京市还特别重视生物遗传资源的传统知识保护。通过在房山区和怀柔区开展试点调查，目前已记录到七百余项与生物多样性相关的传统知识，涵盖农业遗传资源、传统文化等多个领域。例如，房山区的磨盘柿种植过程中形成的独特口述性与实践性遗传资源体系，就具有重要的保护价值。
在监测网络建设方面，北京市初步构建了覆盖全市的生物多样性观测体系。通过在不同区域开展鸟类、哺乳动物和蝴蝶等指示性生物的观测工作，基本摸清了本市的生物多样性本底情况。2025年的观测数据显示，本市共记录到839种指示性生物，其中包括45种国家级重点保护野生动物。
这些研究成果不仅为城市总体规划和生态补偿提供了科学依据，还显著提升了北京市的生态环境质量。近年来，北京雨燕、丹顶鹤等珍稀物种频繁现身，充分展现了本市生物多样性保护工作的成效。目前，北京市的生物多样性水平已位居全球大都市前列，成为首都生态文明建设的重要成果。